Online inchecken is mogelijk via de website van Pegasus Airlines, ook via mobiel. Je doet dit vanaf 72 uur tot 2 uur voor de geplande vertrektijd.
Het is ook mogelijk om in te checken op de luchthaven bij de incheck-balie van Pegasus Airlines. De incheck-balie opent meestal 3 uur voor het vertrek van de vlucht.